Burette 简介
Burette 把分子预览、结构检查和集合浏览整合到一个 Mac 工作区中。在访达中选中一个分子文件并按空格键,它的快速查看扩展就会以 3D 显示结构,可以直接旋转和缩放。打开应用本身则可以使用完整的工作区,包括标签页、项目边栏、命令面板和侧边面板,你可以在其中查看蛋白质及其配体、逐帧浏览轨迹、按性质筛选化合物或绘制分子。
Burette 用 Mol* 查看器打开大多数结构文件,包括 PDB、CIF、SDF、MOL2 和 XYZ,并用基于 RDKit 的网格显示 SDF、SMILES、CSV 和 TSV 集合,支持搜索、排序和 SMARTS 筛选。它还能打开分子动力学轨迹和质谱文件,并内置用于小分子的 Ketcher 编辑器;大分子编辑尚未启用。部分格式需要另外安装 xyzrender 程序。该项目由 Sergei Nikolenko 和其他贡献者以 MIT 许可证开发。当前的 Mac 版本需要 Apple 芯片 Mac 和 macOS 12 或更高版本;下载大小约 209 MB。2026.10.38 版修复了快速查看预览中的一个问题。
主要功能
Burette 是面向所有处理分子文件的人的查看器和工作区。
- 快速查看:在访达中按空格键即可以 3D 查看分子文件。
- Mol* 查看器:旋转、缩放、聚焦到链,并选择显示方式。
- 多种格式:PDB、CIF、SDF、MOL2、XYZ、GRO 等众多格式。
- 集合:浏览 SDF、SMILES、CSV 和 TSV 文件,支持搜索、排序和 SMARTS 筛选。
- Ketcher 编辑器:绘制小分子,并发送到查看器或网格。
- 轨迹:用播放控件逐帧浏览分子动力学轨迹。
- 光谱:在光谱查看器中打开质谱文件。
- 工作区:标签页、项目边栏、命令面板,以及用于比较结构的停靠面板。
2026.10.38 版本新功能
Burette 2026.10.38 是一个问题修复版本。
- 访达中的快速查看预览现在会加载所有共享的查看器辅助文件。
Burette 常见问题
Burette 免费吗?
是的。Burette 免费且开源,采用 MIT 许可证。
Burette 有什么用途?
Burette 用于预览和检查分子文件。你可以 3D 查看结构、比较化合物、浏览集合、逐帧查看轨迹并绘制小分子。
哪些 Mac 可以运行 Burette?
当前的 macOS 版 Burette 需要 Apple 芯片 Mac 和 macOS 12 或更高版本。这些版本不支持 Intel Mac。
如何在访达中预览分子文件?
先从"应用程序"文件夹打开一次 Burette,让 macOS 注册它的快速查看扩展。然后在访达中选中受支持的文件并按空格键。
Burette 能打开哪些文件格式?
大多数结构文件在 Mol* 查看器中打开,包括 PDB、CIF、MMCIF、SDF、MOL、MOL2、XYZ 和 GRO。它还能打开 SMILES、CSV 和 TSV 集合、分子动力学轨迹和质谱文件。
可以在 Burette 中编辑分子吗?
可以编辑小分子。Burette 内置 Ketcher 编辑器,用于绘制和编辑小分子。大分子编辑尚未启用。
Burette 需要其他软件吗?
大多数文件不需要。部分格式会使用外部渲染器 xyzrender,需要另外安装;安装了 VESTA 时,还会出现可选的转交到 VESTA 的功能。
快速查看预览不显示怎么办?
在 Burette 中打开命令面板并运行 Reset Quick Look。Open Logs Folder 和 Export Diagnostics 也在那里。
可以用 Homebrew 安装 Burette 吗?
可以,通过开发者的 tap:先运行 brew tap SergeiNikolenko/burette,再运行 brew install --cask burette。
burette.FULLMAC.app 上的 Burette 下载来自哪里?
下载按钮指向 GitHub 上的官方 Burette 发布页面 https://github.com/SergeiNikolenko/Burette/releases/latest。burette.FULLMAC.app 不会修改或重新打包该应用。
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